סיבה מרכזית לכך ה-X-Files הפך כל כך מפורסם ומשפיע עד שהכותבים עשו דברים עם הסיפורים שלהם שכותבי טלוויזיה אחרים לא היו עושים. הם התנסו ברעיונות שצללו אל העל טבעי והמוזר. לפעמים, הניסויים האלה הסתיימו בכישלונות קשים שהמעריצים היו רוצים לשכוח מהם. פעמים אחרות, זה הוביל לעבודה פורצת דרך שדחפה את הגבולות של מה שהטלוויזיה יכולה לעשות ומה לא יכולה לעשות, כמו גם כמה פרקים מדהימים.
סרטון היום של CBR גלול כדי להמשיך עם התוכן
כך או כך, השאיפות של הכותבים עוררו לא מעט מחלוקות. לפעמים, התוכנית הפחידה אנשים קצת יותר מדי. לפעמים, הפוליטיקה שלה גרמה לריב, ולפעמים הכותבים סיכנו את זעמם של המעריצים בניסויים נועזים. התוצאות של המחלוקות הללו נעו בין הסתה של כעס עז מצד המעריצים ועד לפרקים שהורדו לאוויר בגלל התוכן שלהם.
10 עונה 4, פרק 2, 'בית'
'בית' נחשב הכי מטריד X-Files פרק . לפי מתנגש , על פי הדיווחים אחד המפיקים התקשר לכותבים ובכה, 'אתם חולים!' זה היה שנוי במחלוקת באותה מידה כששודר. הוא שודר פעם אחת והמשיך להישאר מחוץ לאוויר במשך שלוש שנים, והופיע רק להופעה מיוחדת בליל כל הקדושים.
מה שאנשים מצאו שהכי מטריד היה שאין איום על טבעי או חריג. לא היו מפלצות, לא שדים ולא חייזרים. הרעים היו משפחה אנושית שנשברה והתפתלה על ידי שנים של התעללות ללא תקווה להימלט. 'הביתה' הייתה אחת הצלילה האפלות ביותר למעמקי הרוע האנושי באותה תקופה, והיא עדיין מטרידה עד היום.
9 עונה 2, פרק 7, '3'
לעשות פרק בלי דנה סקאלי היה משימה קשה. אמנם לא ניתן היה לעזור לחופשת ההיעדרות של ג'יליאן אנדרסון עקב הריונה, אבל המעריצים לא התכוונו לשמוח מזה. מצד שני, זו הייתה הזדמנות עבור הכותבים לנסות משהו חדש. למרבה הצער, מה שהם הגיעו לא התקבלו היטב.
'3' של עונה 2 נכתב כמותחן אירוטי על טבעי, שהיה יציאה אדירה מהזווית הבלשית/מדע בדיוני הרגילה. TXF בדרך כלל היה. יתר על כן, זה בקושי התייחס בצערו של מאלדר על חטיפתו של סקאלי. שתי אפשרויות הכתיבה היו שנויות במחלוקת רבה בקרב מעריצים שחשו שסקאלי ראויה ליותר תשומת לב בין אם היא שם ובין אם לא.
8 עונה 5, פרק 7, 'אמילי'
'אמילי' של עונה 5 הוא אחד הפרקים העצובים בתוכנית. סקאלי גילתה שיש לה בת ביולוגית בשם אמילי שנוצרה מה-DNA שלה ללא ידיעתה. היא ניסתה לטפל בה, אבל אמילי הייתה חולה אנושות ומתה.
הפרק הזה היה אחת מני סיבות רבות לכך שהמעריצים האמינו שהכותבים מתעללים בסקאלי. הפגיעה באוטונומיה הגופנית לבדה הייתה מחרידה מספיק. גרוע מכך, זו לא תהיה הפעם הראשונה ה-X-Files להעביר אותה את זה. יתרה מזאת, סקאלי עברה מלקבל את אי הפוריות שלה לגילוי בתה הלא ידועה לאיבוד בתה תוך מספר שבועות בלבד. זו הייתה צליפת שוט רגשית שהכותבים לא השקיעו מספיק מאמץ כדי לחקור.
מסטיק ראש שלוש פלוגים
7 סיפור חייל העל
עלילת חייל-העל הייתה החלטה שנויה במחלוקת שזכתה לביקורות רבות מזמן X-Files מעריצים. הרעיון של פולשים חייזרים מחליפים בני אדם בהכלאות אדם-חייזרים נשמע טוב על הנייר. עם זאת, זה לא בוצע היטב בתוכנית.
הקשת החמירה את הבעיות הקיימות, כמו נרטיב מפותל ומיתולוגיה מופרכת יותר ויותר. כמו כן, זה הוביל לרעיונות סיפורים אחרים שהסתכמו רק בטראומה של סקאלי ומאלדר מבלי להביא לצמיחת אופי אמיתית או קתרזיס. הרעיון הזה היה אחד מני הרבה סימנים לכך ה-X-Files היה בירידה .
6 עונה 7, פרק 20, 'מועדון קרב'
ב'מועדון קרב', זוג תאומים גרם למהומה וכאוס בכל מקום אליו הלכו. אנשים נקלעו למריבות, זכוכיות התנפצו, והם אפילו גרמו לרעידות אדמה. כביכול, הם קיבלו את זה מאבא שלהם, אבל זה מעולם לא הוסבר במלואו. הבעיה מעולם לא נפתרה, ומאלדר וסקאלי נותרו מוכים וחבולים עד הסוף.
כתיבת הפרק הזה הייתה החלטה שנויה במחלוקת בפני עצמה. זה היה כאילו הכותבים לא יכלו להחליט אם ללכת על פרק מצחיק או לשחק אותו ישר. כתוצאה מכך, הביצוע של הסיפור היה נורא, והפרק ירד כפרק הגרוע והשנוא ביותר של התוכנית.
5 עונה 10, פרק 5, 'בבל'
הפרק 'בבילון' היה מאוד שנוי במחלוקת, לא רק בגלל התוכן אלא בגלל אופן הטיפול בתוכן. בפרק, קבוצת מחבלים איסלאמיים מפציצה גלריה לאמנות. מאלדר וסקאלי מזווגים עם עמיתיהם הצעירים יותר ומשתמשים באמצעים על טבעיים כדי לתקשר עם אחד המפציצים ההרוגים.
הכותבים כבר בוחשו את הסיר כשהם מרכזו את הפרק בנושאים כל כך נוגעים כמו טרור ואיסלאם. עם זאת, הם טיפלו בנושאים האלה בצורה לא רגישה. הוא הסתמך יותר מדי על סטריאוטיפים ומעולם לא התייחס לסוגיה האמיתית של דעות קדומות. בנוסף, הרגעים הקומיים של הפרק הרגישו מאולצים, והביאו לטון לא אחיד שהתהפך בין טמטום לרצינות.
4 עונה 4, פרק 3, 'Teliko'
'Teliko' לא היה הפרק הראשון בו ה-X-Files לגעת בנושא גזע ודעות קדומות. באופן טבעי, תוכן כזה היה גורם לסערה בקרב הצופים בין אם הפרק היה טוב או לא. עם זאת, הטיפול בפרק בנושאים אלה גרר ביקורת רבה.
האנטגוניסט היה מהגר אפריקאי עם מצב נדיר שהעניק לו מראה לבקן ללא טיפול. מצבו התעלם מההתקדמות המדעית, ולכן הוא נאלץ למצוא טיפול משלו. עם זאת, הוא עשה זאת על ידי גניבת בלוטות יותרת המוח מגברים שחורים אחרים, מה שהעניק להם גם מראה לבקן. ההשלכות של הפשע שלו גרמו לדיונים סוערים רבים על זהות גזעית, והם עדיין עושים זאת.
3 עונה 11, פרק 1, 'המאבק שלי III'
הבעיה הכי גדולה עם 'המאבק שלי III' היה הטוויסט בסוף. לידתם של בנם של סקאלי ומאלדר גרפה את שניהם על פני הגחלים עם תמורה קטנה. הגילוי האחרון הזה של אביו האמיתי של ויליאם החמיר את הכל פי עשרה עבורם בלי סיבה מלבד ליצור דרמה. כמובן, תמיד יש סיכוי ש-CSM משקר, אבל ה-X-Files הִתחַדְשׁוּת נותר ללא החלטה בחזית זו.
פרק הסיום של עונה 10 חשף גם את האירועים שלפני כן היו חזון של סקאלי במהלך התקף. בעוד שסוג זה של גימיק עבד היטב בסיפורים אחרים, הוא לא נחת בפרק הזה. הצטברות של עונה שלמה נמחקה לחלוטין והותירה את האוהדים מרגישים נבגדים. זו הייתה התחלה קשה לעונה הכי שנויה במחלוקת בסדרה כולה.
2 גמר עונה 11
הסיום של עונה 11 היה הדובדבן על גבי כוס השמן המלוחה עבור כל כך הרבה מעריצים. כל הדמויות נותרו למטה בצורה כלשהי של האחרת. קשת הגאולה של מוניקה רייס בוטלה לחלוטין, והיא ווולטר סקינר נאלצו להרוג זה את זה במשיכת לב זולה.
בינתיים, כל הסיפור של סקאלי, מאלדר ובנם סוכר מחדש ללא סיבה. עם זאת, במקום להתעכב על האובדן שלהם, הכל השתפר איכשהו מהעובדה שסקאלי הייתה בהריון שוב . ג'יליאן אנדרסון הייתה כה מזועזעת מחוסר הכבוד שהופגן כלפי דמותה שהיא עזבה את התוכנית סופית, ולמעשה סיימה כל תוכניות לעונה עתידית. הפרק הזה היה מעורר ענק בין אם הוא נועד או לא.
1 הסיפור של וויליאם
הסיפור של בנם של סקאלי ומאלדר, וויליאם, היה שנוי במחלוקת ביותר ממובן אחד. קודם כל, העלילה הייתה מפותלת ומלאת חורים. מקורותיו של וויליאם היו מעורפלים ולא ברורים שלא לצורך. אפילו הטוויסט היה נתון לבדיקה מכיוון שהוא הגיע ממקור לא אמין.
שנית, הסיפור היה אכזרי ביותר כלפי מאלדר וסקאלי. הם נאלצו לוותר על התינוק שלהם למען הגנתו, וזה היה מספיק עצוב. לאחר מכן, התברר כי וויליאם לא היה בנו של מאלדר, אלא בנו של מעשן הסיגריות שהכניס את סקאלי בכוח ללא ידיעתה. לבסוף, וויליאם זייף את מותו מבלי לספר להוריו, רק כדי שסקאלי תגלה שהיא שוב בהריון. כל הסיפור היה קשה לצפייה, והוא עורר הרבה כעס על איך שהכותבים התייחסו לסקאלי.
