בעולם של הושמט , השממות מוצפות כמעט לחלוטין בתועבות מוטציות שלא יחשבו דבר כדי להפוך אתכם לארוחה הבאה. אחד הידועים לשמצה מבין היצורים הללו הם המוטנטים העל. מפלצות ענק ירוקות אלה היו פעם בני אדם; עכשיו הם עברו מוטציה ליצורים אלימים דמויי האלק.
בניגוד לרוב יצורי השממה האחרים, המוטנטים העל לא היו תוצאה של נשירתם הגרעינית של הפצצות. במהלך המלחמה בין ארצות הברית לסין לפני האפוקליפסה בשנת 2077, סניפים רבים של הממשלה וכמה תאגידים פרטיים הוטל עליהם לפתח פריצות דרך כדי להשיג יתרון על האויב. פרויקט אחד היה הנגיף האבולוציוני הכפוי, וירוס שנוצר באופן מלאכותי על ידי ווסט טק שנועד במקור להגן מפני צורות שונות של לוחמה ביולוגית. כשהפוטנציאל האמיתי שלו התגלה, עבר הפרויקט לבסיס הצבאי מריפוסה במערב התיכון, בתקווה ליצור את חיילי העל האולטימטיביים.
בני האדם שנבדקו על ידי FEV הציגו כושר גופני מעולה, עמידות בפני נזקי לחימה, הזדקנות, מחלות ורמות קרינה גבוהות. עם זאת, המוטציות הללו הפכו לרוב לאינטליגנטיות הרבה פחות ואלימות ביותר לכל אדם וכל דבר שלא היה אחד מהם. בנוסף, התמורות שלהם הביאו לאיבוד כל איברי הרבייה שלהם, מה שהופך אותם ללא מיניים וסטריליים. משמעות הדבר היא כי סופר מוטנטים אינם יכולים להתרבות באופן טבעי, והדרך היחידה להרוויח יותר הייתה על ידי הפיכת בני אדם רבים יותר באמצעות הנגיף.
לפני שהמדענים במריפוסה הצליחו להשלים את מחקריהם, חיל המצב המקומי בראשות קפטן רוג'ר מקסון גילה את האמת על עבודתם ונודע להם שהם מכפיפים אסירי מלחמה בפני ה- FEV. הם נחרדו, הם מרדו והוציאו להורג את צוות המחקר, ואטמו את ה- FEV לפני שבסופו של דבר עשו את דרכם לבונקר Lost Hills כדי ליצור את אחוות פלדה . עד לאירועים שהובילו ליצירת צבא סופר מוטאנט אמיתי ראשון, הבסיס היה שוכב נטוש במשך עשרות שנים.
בשנת 2102 הובילה משלחת למריפוסה על ידי סוחר רכז בשם הרולד ושומר קמר לשעבר בשם ריצ'רד גריי. כשפרצו, הם הותקפו על ידי האבטחה האוטומטית של הבסיס, כמו גם כמה מוטציות ששרדו. כל חברי הצוות נהרגו למעט הרולד שנפצע אך הצליח להימלט וגריי, שהוטח בטעות לאחד מכלי ה- FEV. החשיפה הממושכת שלו לנגיף הובילה אותו להיות מסה של בשר מוטציה להחריד אך עם אינטליגנציה מוגברת מאוד, שנולדה מחדש כ'המאסטר '. מוטציות נוספות העניקו לו יכולת קישור נוירו למחשבים, מה שאפשר לו לגשת למאגרי הבסיס.
באמצעות ניסויים הוא הצליח ליצור סופר מוטנטים חדשים, שחלקם עדיין שמרו על האינטליגנציה שלהם. מתוך אמונה שהמוטנטים הללו הם היחידים שיכולים אי פעם לשרוד בשממה, הוא החל במאמצים לבנות צבא על ידי חטיפת מתנחלים אנושיים והפיכתם לפועל, תוך שימוש בכתת יום הדין של חסידים אנושיים כפעולה חזיתית. עם זאת, מאמצים אלה סוכלו על ידי התערבות בזמן של קמרון הדת והאחים, שהובילו התקפה על בסיס מריפוסה והשמידו אותה והרגו את המאסטר.
כשהמאסטר מת ורוב צבאו נרדף על ידי האחים, ברו סופר מוטנטים לשממה כדי לנסות לבנות לעצמם חיים חדשים. מאמץ כזה עשה המוטציה האינטליגנטית מרקוס, ובאופן מפתיע, פלדין אחווה בשם ג'ייקוב. למרות היותם אויבים, עד מהרה הם הפכו לחברים גדולים, והקימו את Broken Hills כמקלט לבני אדם, גולמים ומוטנטים לחיות בהרמוניה. מאוחר יותר גויס מרקוס על ידי הנבחר כדי להצטרף למסעו להציל את שבטו ואת שאר השממה מהמובלעת.
כאשר המובלעת קמה מחדש בשנת 2241, הם ניסו להשתמש ב- FEV כדי לסייע לרצח עם עולמי על ידי שינוי זה כדי להרוג כל דבר עם DNA מוטציה. באמצעות מתנחלים שנתפסו על ידי NCR שנאלצו לעבדות, הם חפרו את חורבות מריפוסה כדי למצוא את כלי הבישול הנותרים של FEV. בדיקותיהם הביאו גם להפיכתו של חייל מובלע בשם פרנק הוריגן להכלאה סופר-מוטאנטית חזקה. לפני שהספיקו לפרוס את הזן המתוקן, הנבחר הסתנן למפקדתם והשמיד את הבסיס יחד עם מאגרם.
לאחר מכן, ללא עוד FEV במערב, סופר מוטאנטים נעשו נדירים יותר ויותר. למרות המאמצים להשתלב בקהילות אנושיות, רבים עדיין לא היו אמונים או שנאו זרים כלפי מוטציות. במוג'אב נוסדה ג'ייקובסטאון במטרה לספק בטיחות למוטציות וטיפול לאלה הסובלים מפסיכוזה ותוקפנות.
מריפוסה אמנם הייתה מרכז המחקר הראשי של FEV, אבל זה לא היה המקום היחיד במדינה שהכיל את הנגיף הידוע לשמצה. במקומות כמו שוממת הבירה, חבר העמים ואפלצ'יה, היו למדענים חנויות משלהם של FEV, בהן השתמשו להתנסות בנושאים שונים. מוטציות-העל האלה היו זהות בעיקר למקביליהן בחוף המערבי, אלא שהוותיקות המשיכו לצמוח והפכו לבובות חזקות. הם גם לא היו בעלי מבנה מנהיגות ברור והיו הרבה פחות מאורגנים, בעיקר בגלל שמוטציות אינטליגנטיות היו נדירות בהרבה. למרות זאת, הם עדיין היו איום חמור באזורים שלהם.
מקורם של מוטציות השממה ההונית קמרון 88 , שהתנסו בתושביהם ב- FEV. פרק האחים המקומי הוביל מלחמה בת 20 שנה להכיל אותם לפני שלמד לבסוף מהיכן הם מקורם והרס את הכספת בשנת 2277. בשלב זה, גם המובלעת התייצבה מחדש, וביקשה להמשיך בתכניותיהם להרוג כל דבר שעבר מוטציה. למרבה המזל, מאמציה נעצרו על ידי הנודד הבודד והאחים תוך השמדת המדגם האחרון הידוע של ה- FEV ששונה.
בחבר העמים, למכון איכשהו היה אספקה משלהם של ה- FEV והחל במאמץ ליצור זן חדש של מוטציות שיפעלו כפועלים וחיילים על פני השטח. בעוד שהחוקרים התמקדו מאוחר יותר בפיתוח סינתזים מתקדמים לתפקידים אלה, המשיך המכון לחטוף מתנחלים ולהפוך אותם למוטנטים לפני ששחרר אותם לטבע. מעולם לא מוסבר מדוע, אך רבים משערים שהמכון עשה זאת בכדי לשמור על סיעות חבר העמים מפולגות ולא מסוגלות לארגן מספיק כדי לאתגר אותן.
מקובל להאמין שאין תרופה לאלה שהפכו לסופר מוטנטים; עם זאת, תיאוריה זו הופרכה באמצעות פעולותיו של ד'ר בריאן וירג'יל. חוקר לשעבר במכון, ורגיל הפך את עצמו לסופר מוטאנט ונמלט לגלות בים הזוהר. בשנת 2287 יצר וירג'יל סרום שהחזיר את המוטציה בהצלחה והחזיר אותו לצורת האדם. עם זאת, התרופה הותאמה לזן FEV הספציפי שהוא הדביק בו, והכללת הנוסחה לריפוי כל אחד אחר עשויה להימשך עשרות שנים.
למרות הידוע לשמצה ברחבי השממה, היו קומץ סופר מוטנטים שעלו מעל התוקפנות שלהם, ושואפים לעשות טוב. מוטציות מסוימות כמו מרקוס, פוקס וחזק אף הפכו לבעלות ברית נאמנות וחזקות לגיבורי שממה אגדיים לאורך ההיסטוריה.
